Group Outputの前に Realize Instancesを入れることで、モディファイアの設定からapplyができるようになる。
結果が全て一つのオブジェクトになっているので、個別のオブジェクトにするには By Loose Parts で分離する。
Mesh → Separate → By Loose Parts
ただし、 By Loose Partsは頂点が繋がっていなければ纏まってくれないので、連続していないパーツが一つのオブジェクトになっている場合はどこかでつなげておかないといけない